当患者在坦桑尼亚达累斯萨拉姆的Mwananyamala医院出现不明原因发热时，科学家们比较了两种基因测序方法，用于识别疾病背后潜在的病毒：VirCapSeq-VERT，一种在感染和免疫中心（CII）开发的方法。哥伦比亚大学的Mailman公共卫生学院，以及无偏见的高通量测序。两种方法都产生了类似的结果。但是，VirCapSeq-VERT效率更高。
 
该研究的详细信息，首次报道VirCapSeq-VERT在临床环境中的应用，今天发表在mSphere期刊上。
 
科学家们使用了12名门诊患者的血液样本，这些患者被认为是发病率最高的病毒感染风险最高的原因。在用一组诊断测定法筛选后​​排除疟疾。在该研究中比较的两种测序方法都鉴定了来自登革热病毒，西尼罗病毒，HIV，人佩吉病毒和爱泼斯坦巴尔病毒的基因序列。然而，无偏倚的高通量测序需要更广泛的样品处理和生物信息学分析，并且比VirCapSeq-VERT需要20倍的序列来实现这些结果。
 
VirCapSeq-VERT是无偏序列的简化版本，它参考了大约200万个遗传片段中的序列库，代表了所有已知感染脊椎动物的病毒类群。这些遗传片用于构成探针，该探针与从待测样品中取出的材料一起引入。磁性过程从样品中“拉出”与探针匹配的区段;然后使用高通量测序分析这些区段。2015年的一项研究报告称，与传统的高通量测试相比，该方法使病毒匹配增加了100到10,000倍。
 
研究人员承认，需要进一步调查以确定坦桑尼亚患者的发热原因，特别是在检测到多个病毒基因组的情况下。一般来说，当VirCapSeq-VERT未能产生候选病毒病原体，或者细菌或其他寄生虫剂未被排除时，研究人员表示应该考虑无偏倚的高通量筛查。该团队目前正在验证将与VirCapSeq-VERT组装的细菌，真菌和寄生虫探针组，以便为​​所有传染性病原体进行测试。
 
“当患者出现发烧时，他或她可能患有许多感染，”CII的研究员，共同首位作者Simon H.Williams说。“当一次一个地测试感染是不切实际的时候，无偏倚的测序可以帮助找到大海捞针。在我们的实际比较中，VirCapSeq-VERT和无偏倚的筛选一样灵敏，但需要更少的资源来满足同样的结果。“
 
“无论是在坦桑尼亚还是德克萨斯州，各地的医生都受到资源的限制，”CII主任，流行病学John Snow教授Ian Lipkin说。“VirCapSeq-VERT被证明是一种非常有效的方式来揭示医疗之谜，因此患者可以得到他们需要的治疗。从公共卫生的角度来看，我们的方法提供了一种经济有效的方法来监测新出现的传染病，以指导预防工作“。