牛津大学开展黄热病病毒（YFV）研究合作，为最近在巴西爆发的特殊疾病及病毒如何传播提供了新的视角。该研究结果对监测病毒传播具有重要意义，并可能有助于制定消除全球YFV的策略。
 
发表在科学，由牛津大学和FIOCRUZ里约热内卢科学家协调国际合作，运用现代基因组学和流行病学技术详细南美最大的黄热病病毒疫情的传播方式调查在最近的历史。便携式DNA测序和计算分析等技术使团队能够了解病毒的基因构成，并分析人类病例的年龄，性别和空间分布。
 
黄热病病毒通过两种方式通过sylvatic（森林）或城市（城市）传播由蚊子传播。最近在巴西发生的YFV病例可以追溯到森林居住的灵长类动物和蚊子-这是sylvatic传播的特征。但是，巴西的历史爆发以及最近在非洲安哥拉爆发的病毒都是由城市传播引起的-这种感染方式可能导致城市大量感染。尽管存在一种非常有效的YFV疫苗，但库存有限，并未向巴西的每个人提供;直到最近，这种疫苗才被提供给居住在被认为处于“高风险”感染的森林地区的人们。
 
2016年黄热病爆发是巴西最大的爆发，持续时间超过100年。有人担心疫情的严重程度可能表明YFV已开始通过城市传播传播-增加了圣保罗和里约热内卢的大城市爆发危险疫情的可能性，疫苗接种覆盖率较低。
 
对包括米纳斯吉拉斯州在内的受影响国家本地产生的YFV病例和基因组数据的分析显示，病毒谱系已经在灵长类动物的传播中传播，在2016年期间未被注意到，在2017年初蔓延到人类群体之前。
 
牛津大学动物学系Henry Dale爵士研究员Nuno Faria博士说：“最终，流行病学和基因组数据的结合告诉我们，巴西的YFV爆发是由sylvatic传播引起的。虽然城市传播的条件似乎存在，但幸运的是没有发生。
 
进一步分析证实，85％的人类和灵长类动物YFV病例均为男性，年龄在35-54岁之间-这是传染病的传播迹象，并且可以迅速应用于评估世界范围内YFV流行病传播的技术。
 
牛津大学动物学系进化与传染病教授Oliver Pybus教授说：“黄热病病毒已经影响了人类数百年。它来自动物水库的波浪，所以我们可能永远不会完全消除它。问题是我们还不了解病毒在动物种群中的复杂行为。我们需要这些信息来控制未来的爆发-在正确的时间，在正确的时间为正确的人接种疫苗'。
 
巴西Oswaldo Cruz基金会（FIOCRUZ-RJ）巴西卫生部黄病毒参考实验室高级科学研究员Luiz Alcantara教授说：'在48小时内，我们能够从爆发的中心产生第一个基因组在米纳斯吉拉斯州。作为ZiBRA项目的一部分，我们使用基因测序跟踪了寨卡病毒的传播，现在已经在巴西培训了数十名研究人员。在短短几周内，使用新的便携式测序方法，我们能够将来自巴西的黄热病病毒基因组数量增加三倍。
 
Nuno Faria博士说：“尽管黄热病是人类历史上最重要的病原体之一，但与其他病原体相比，黄热病的研究资金不足，因此新技术可以带来新的见解。至关重要的是，结合使用基因组学和流行病学方法，我们现在开始了解病毒如何在空间和时间从动物种群跳跃到人类的“隐藏”动态。这些发现证明了新兴技术的优势，例如MinION DNA测序仪，用于现代医学。