丙型肝炎病毒（HCV）主要通过大量或反复的经皮注射传播（如静脉药瘾者针头被病毒污染），血液、血制品、器官移植传播（1992年以后罕见），医疗机构工作人员被针刺误伤，以及母婴传播。不常见的传播途径有：性传播；与丙肝患者共用个人物品，如剃须刀或牙刷；其他侵入性医疗操作。丙型肝炎病毒感染的高危人群有静脉吸毒成瘾者；1987年以前接受凝血因子治疗者；1992年以前接受输血和实体器官移植者；长期血液透析；职业暴露，如医护人员被针头误伤，而针头有丙肝患者的血液污染；HIV感染者；丙肝母亲的下一代。丙型肝炎病毒感染中有75%-85%发展为慢性感染；60%-70%发展为慢性肝炎；5%-20%在20-30年后形成肝硬化；1%-5%最终因肝癌或肝硬化死亡。
 
应该接受丙型肝炎病毒感染筛查的人有1945-1965年出生的人；静脉吸毒者，哪怕是在多年前只静脉吸毒一次者；1987年以前输注过凝血因子者；1992年7月以前接受过输血或实体器官移植者；长期接受血液透析的患者；职业暴露，如医护人员被针刺误伤；所有HIV感染者；有肝病临床表现者（例如转氨酶升高）；丙肝母亲所生下一代（为避免母体抗体的混淆，18月龄前不筛查）。
 
丙型肝炎病毒感染的筛查试验有丙肝抗体检测，有酶免疫测定法和增强化学发光免疫分析法，确诊试验有HCV定性和定量检测（PCR)。HCV在暴露后4-10周，可测到丙肝抗体（酶免疫测定法）；暴露6个月后，超过97%的人仍可检测到丙肝抗体；最早于暴露后2-3周，可检测到HCV RNA。
 
大多数慢性感染者是无症状的，但病情可持续发展，从轻度到重度，甚至发展为肝硬化或肝癌。病情发展呈隐匿性，在几十年的进展恶化过程中可无症状和体征。事实上，很多无症状HCV感染者只是在常规检查中，当发现丙型肝炎病毒检查的阳性结果或转氨酶升高时才被发现。
 
丙型肝炎病毒至少有6个基因型，50个亚型。在治疗前基因检测是必须的，因为基因检测有助于了解丙肝感染的流行病学，并确定治疗方案。基因型确定后不用再复查，因为在整个感染过程中病毒基因型不会改变。慢性HCV感染并不仅局限于肝损伤，还可引起其他疾病，被认为与免疫反应有关。HCV感染者糖尿病的发生率增加3倍，可引起肾小球肾炎、混合性冷球蛋白血症、迟发性卟啉症、非霍奇金淋巴瘤发生率增加。自2011年以来，随着高效HCV蛋白酶抑制剂的研发成功，慢性丙肝的抗病毒治疗取得了突飞猛进的发展，治愈丙肝已成为可能。