蛋白质是通过肽键连接的氨基酸聚合物,它们是存在于生物体内的主要生物分子类别之一。蛋白质参与各种细胞功能和事件,如细胞信号传导,细胞粘附,代谢反应,免疫反应的产生等等。
已知蛋白质与其他蛋白质在物理上化学相互作用以维持规律的生理功能。这些相互作用称为蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)。蛋白质中任何形式的功能失常都会导致体内平衡受到干扰,最终,身体的所有生理功能都会受到干扰。在对几种环境和生化刺激的反应中,正常蛋白质可以突变并开始与另一种蛋白质相互作用,导致异常PPI的形成。类似地,还可以形成致病蛋白,其成为发病机理的组成部分,导致对宿主细胞的不利影响。简而言之,蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)被认为是细胞维持的关键特性。
从过去几年开始,已经将实验和计算方法应用于PPI,以确定它们的相互作用,异常和导致疾病或细胞功能中断的各种原因。
Krishna Mohan Poluri及其同事的详细综述让读者深入了解了帮助研究人员了解PPI参与各种临床疾病的过程以及如何通过计算方法检测这些PPI的方法。该评论涵盖了用于预测,存储和可视化PPI的计算方法。接下来解释这些计算方法中的解码过程,以确定诸如感染因子的来源或影响PPI的特定疾病状态的因素。然后,他们专注于用于设计新型小分子抑制剂的计算方法,这些抑制剂可破坏蛋白质-蛋白质相互作用并有效地抵抗衰弱性疾病的影响。研究人员提供了有用的图表,列出了不同的计算工具和数据库。这些图表可以帮助读者为他们的研究项目选择他们的方法。通过计算方法研究PPI的研究人员面临的挑战总结也在他们的总结发言中提出。
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